3D Print een eiwit: modellering van een moleculaire Machine (2 / 6 stap)

Stap 2: Installeer PyMOL



PyMOL is een gratis en open-source modellering en visualisatie programma voor kleine moleculen en eiwitten. PyMOL heeft een actieve en groeiende Gemeenschap, evenals een aanzienlijk deel van de markt in de wetenschappelijke literatuur, waardoor het een perfect hulpmiddel om te gebruiken voor de creatie en aanpassing van moleculaire modellen. PyMOL kunt u maken en visualiseren van moleculaire modellen, van de traditionele bal en stick model dat benadrukt atomen en obligaties, naar de ruimte vullen modellen die volume en oppervlakken benadrukken. Wij zullen worden afdrukken een ruimte vullen model in dit instructable te geven een idee van wat een eiwit zou eigenlijk uitzien.

De PyMOL Wiki heeft uitstekende documentatie over hoe PyMOL voor alle moderne besturingssystemen installeren. De belangrijkste PyMOL website heeft vooraf samengesteld bouwt voor zowel Mac en Linux beschikbaar. Gelukkig hoeft niet je eigen Windows uitvoerbare uit de broncode compileren (hoewel u zeker kunt als je wilt) - anderen hebben gelukkig al gedaan en de resultaten openbaar gemaakt. Ik zal laten zien stappen zoals geïllustreerd hier voor een installatie van Windows, want dat was het besturingssysteem dat ik gebruik gemaakt.

PyMOL op Mac installeren:
http://www.pymolwiki.org/index.php/MAC_Install

PyMOL installeren op Linux:
http://www.pymolwiki.org/index.php/Linux_Install

PyMOL installeren op Windows:
http://www.pymolwiki.org/index.php/Windows_Install

Kort, en geïllustreerd:

  1. Volg de link vermeld in stap 2 van de installatiehandleiding van Windows op de PyMOL Wiki.
  2. Download de juiste versie van PyMOL (aangezien de Python 2.7 ik eerder geïnstalleerd is 64 bits, ik zal het installeren van de 64-bits PyMOL bestand, pymol-1.6.0.0.win-amd64-exe py2.7.).
  3. Zodra u de .exe PyMOL hebt gedownload, voert u het installatieprogramma. Gebruik van alle standaardinstellingen van de installatie.
  4. Om te voeren PyMOL, navigeer naar C:\Python27\PyMOL in uw bestandssysteem en de PyMOL.exe-toepassing wordt uitgevoerd. (U kunt ook een snelkoppeling op het bureaublad maken op dit moment).

Nu tijd om te vinden sommige eiwitten!

Gerelateerde Artikelen

Een gratis super gemakzuchtige oplossing te halen van een 3D-Model van jezelf met uw Microsoft Kinect en 3D Print.

Een gratis super gemakzuchtige oplossing te halen van een 3D-Model van jezelf met uw Microsoft Kinect en 3D Print.

Met deze ' staat dat ik wil je laten zien hoe makkelijk het is voor u een scan van uzelf of uw gezin zonder enige software te kopen zolang u een Kinect hebt of kunt lenen een. Ook degenen die niet de eigenaar van een 3D-printer laten zien waar ze kun
Bouw een 3D Model van een Nederlandse windmolen (in 1:100 of 1:160 schaal) afgedrukt

Bouw een 3D Model van een Nederlandse windmolen (in 1:100 of 1:160 schaal) afgedrukt

Dit instructable wandelingen door de bouw van een 3D Printed kit die een soort windmolen modellen verspreid van Noord-Europa maar meestal gedacht aan met betrekking tot Nederland. Het idee werd geboren in een gesprek over het soort landschap dat zou
3D Print een sculptuur van uw DNA

3D Print een sculptuur van uw DNA

Zou het niet gaaf om te interageren fysiek met een model van uw genetische code?Dit Instructable zal u tonen hoe te gebruiken gratis tools te downloaden van uw gegevens ruw genoom van 23andme en genereren van een 3D-model, die u op uw computer bekijk
Hoe maak je een 3D-printbaar CAD Model van MIJNHEER Scans

Hoe maak je een 3D-printbaar CAD Model van MIJNHEER Scans

ik doe onderzoek met Professor Chris Lee op Olin College op het draaien van medische scans in 3D-printbaar modellen voor gebruik in de behandeling van kanker.Het basisidee is om een stapel van 2D medische scans, in dit geval van prostates met kanker
3D modellering van een vork voor afdrukken in 3D

3D modellering van een vork voor afdrukken in 3D

deze video begeleidt u hoe aan 3D-model een vork. Het behandelt de geëxtrudeerde baas en geëxtrudeerde gesneden tools. Het is de goede praktijken voor het gebruik van beginner niveau hulpmiddelen in Solidworks, aangezien er geen enkele rationele rede
Tips voor gebruik van een openbare 3D Printer - een persoonlijke Checklist aanpak

Tips voor gebruik van een openbare 3D Printer - een persoonlijke Checklist aanpak

wanneer een openbare 3D-printer, zoals op de locatie van een Techshop of op een maker space overwegen om de volgende tips en ideeën1) wat te doen elke keer dat u bent bezig met afdrukken2) instellingen die zijn opgeslagen in de software door andere g
Een miniatuur werkend model van een filmprojector

Een miniatuur werkend model van een filmprojector

Ik heb een miniatuur werkend model van een filmprojector "Victoria-1", Italië, 1920 bij zelf in thuisstudio uit schroot materialen gemaakt. Dit model is volledig met de hand met minimaal voor tools gemaakt. De film werd gemaakt met beelden van é
Model van een gebouw

Model van een gebouw

wat je maken?Aangezien ik ben klaar om af te gaan in het college besloten heb ik om een stage bij een lokale architectenbureau. Daar leerde ik veel dingen en ik had de grote kans om een model van één van de gebouwen die ze bezig waren. Om dit model,
Maken van een model van de vrijstelling van Edgewood Park

Maken van een model van de vrijstelling van Edgewood Park

ik heb met TechShop voor enige tijd nu en ik genieten van het gebruik van de Epilog Laser graveur. Ik ben altijd op zoek naar projecten om te pronken met haar unieke mogelijkheden.Mijn vriendin behoort tot een groep van vrijwilligers die het verwijde
Hoe maak je een Model van de luchthaven in Sketch Up

Hoe maak je een Model van de luchthaven in Sketch Up

In deze Inscrutable maakt u een model van een deel van een luchthaven. Als u wilt maken dit, moet u het programma Sketch Up te gebruiken.Stap 1: De hoofdterminal maken en beginnen de wandeling manierMaak een vierkant die een lengte van de zijde van 4
Hoe maak je een DNA Model van Candy

Hoe maak je een DNA Model van Candy

DNA is deoxyribonucleic acid. Het bevat de genetische instructies gebruikt in de werking en de ontwikkeling van alle levende orgainisms en sommige viruse. Vervelen met uw project op DNA? Besefte dat zij morgen verschuldigd is? Goed blijven lezen, zel
Model van een Mark iv (Tank)

Model van een Mark iv (Tank)

dit is een model van de Mark iv (tank) zonder de oorspronkelijke sturende staart.  Geïmplementeerd door Groot-Brittannië tijdens de eerste Wereldoorlog in 1916, was het's werelds eerste bestrijding tank.  Dit revolutionaire concept voor een voertuig
Het Model van een draagbare Stick Prop

Het Model van een draagbare Stick Prop

Waarschuwing: dit is de papieren versie en het model van een draagbare stick, niet voor echte gebruik.Hoe het idee werkt is dat het is draagbaar en gemakkelijk om te reizen met ze kan gewoon druk op de rode knop op de bovenste hoofd van de stok zodat
Hoe maak je een model van een pokemon stad

Hoe maak je een model van een pokemon stad

Dit instructable toont hoe maak je een miniatuur model van een stad Pokemon HeartGold of SoulSilver. Hoe maak je individuele stukken zal het zeggen, maar het is aan jou om te achterhalen van de lay-out van de stad die u uitproberen zal te halen. Dit