Stap 1: Installeer VirtualBox en FreeSurfer (en converteren DICOM aan NIFTI)
(Dit zijn instructies voor Windows. Als u Linux voor Mac kunt u direct met behulp van de instructies op de FreeSurfer websiteFreeSurfer)
- VirtualBox voor "Windows hosts x86/amd64" installeren via deze link (~ 110 MB)
- Download en haal de FreeSurfer Virtualbox (van Xubuntu) afbeelding van hier (~ 9 GB)
- Volg deze instructies om te installeren FreeSurfer voor VirtualBox. Ik adviseer gebruikend meer geheugen dan zij gebruiken (zoals 2-4GB).
-----------
Als u uw bestanden van de MRI in DICOM hebt-kunt u converteren met behulp van het hulpmiddel van de dcm2nii door MRIcron: win.zip
(Als ze al in NIFTI formaat, dan u kunt deze stap overslaan.)
- Uittreksel de bestanden en de open dcm2niigui.exe
- Klik op "bestand -> DICOM aan NIFTI"
- Selecteer de map met je DICOM-bestanden in en klik op "open"
- Het programma moet worden uitgevoerd voor een paar seconden
- Binnen uw DICOM-map moet nu er een of meer. nii.gz bestanden. Indien in twijfel gewoon gebruik maken van grootste. Ik omgedoopt tot het "brainscan.nii.gz" gemakkelijker te vinden en te behandelen.
Ook kunt u DICOM-bestanden rechtstreeks in de FreeSurfer, maar voor de eenvoud ik neem aan dat u gebruik NIFTI bestanden.
(meer informatie op dcm2nii kan worden gevonden hier)
-----------