Stap 5: Stap 5: ImageJ en image stitching
Dit project is sterk afhankelijk van een afbeelding plugin ontwikkeld voor imageJ door Stephan Preibisch stiksel. Deze plugin kan hier worden gevonden: http://fly.mpi-cbg.de/~preibisch/software.html#Sti...
Deze plugin wordt ervan uitgegaan dat de beelden naam op een sequentiële wijze zijn en in dezelfde map worden opgeslagen. Hiermee kunt u opgeven van de relatieve locatie van elke afbeelding via het patroon zijn opgenomen (bijvoorbeeld slang van links naar rechts), en het aantal kolommen en rijen. Deze plugin kan worden ingesteld op batch geautomatiseerd worden. Een afbeelding van de eenvoudige macro waarmee dit script is:
uitvoeren ("Grid/collectie stiksel", "type = [raster: slang door rijen] volgorde = [recht & Down] grid_size_x = *** aantal kolommen *** grid_size_y = *** aantal rijen *** tile_overlap = 35 first_file_index_i = 1 map = [*** Image Directory ***] file_names = *** DIRECTORY/procesnaam *** _ {iiii} .jpg output_textfile_name=TileConfiguration.txt fusion_method = [lineaire Blending] regression_threshold = 0.30 max/avg_displacement_threshold = 2,50 absolute_displacement_threshold = 3,50 compute_overlap subpixel_accuracy computation_parameters = [geheugen besparen (maar trager)] image_output = [Fuse en display]");
uitvoeren ("RGB kleur");
uitvoeren ("Save", "opslaan = [*** OUTPUT PROCESNAAM en DIRECTORY ***]");
Close();
Close();
Vervang tekst gesteund met *** met relevante informatie.
Op dit punt moet u klaar om te gaan. Er zijn vele manieren om dit systeem te verbeteren en, als je dat doet, laat het me weten.